| 한글제목(Korean Title) |
퇴행성 뇌질환 도메인의 유전자-질병 상관관계 자동 큐레이션 시스템 |
| 영문제목(English Title) |
An automatic curation system for extracting gene-disease associations specific to the neurodegenerative disease |
| 저자(Author) |
이헌우
전준범
백경민
원정임
김윤중
윤지희
Heonwoo Lee
Junbeom Jwon
Kyeongmin Baek
Jungim Won
Yunjoong Kim
Jeehee Yoon
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| 원문수록처(Citation) |
VOL 49 NO. 01 PP. 0065 ~ 0067 (2022. 06) |
한글내용
(Korean Abstract) |
정밀의학의 실현을 위해서 유전자 정보, 질병 정보, 변이 정보들의 상호 연관성 파악에 기초한 데이터베이스 구축이 필요하다. 이러한 데이터베이스 구축은 일반적으로 해당 분야의 전문가가 의생물학 문헌에 대한 수동 큐레이션 작업을 통해 생성되며 많은 시간과 노력을 필요로 한다. 우리는 선행 연구에서 유전자-질병 상관관계를 자동 추출하여 특정 질병과의 연관성을 판별하는 딥러닝 모델을 제안하였다. 본 논문에서는 해당 딥러닝 모델을 기반으로 하는 유전자-질병 상관관계 자동 큐레이션 시스템의 개발에 대하여 기술한다. 제안하는 시스템은 키워드 검색 기반으로 PubMed 문서로부터 퇴행성 뇌질환 도메인의 유전자-질병 상관관계를 자동 추출하고 상관관계의 적합도를 수치로 반환하여 전문가의 수동 큐레이션 작업에 필요한 시간과 노력을 줄인다. 또한, 유전자-질병 상관관계를 추출한 문헌 및 문장에 대한 추가 정보를 제공하여 전문가의 심화된 큐레이션 작업 및 데이터베이스를 구축을 지원한다. 특히, 제안하는 큐레이션 시스템은 시스템의 지속적 운용에 따라 축적되는 새로운 유전자-질병 상관관계 데이터를 활용하여 예측 모델의 성능을 추가적/지속적으로 개선 가능하다는 점을 장점으로 들 수 있다. |
영문내용
(English Abstract) |
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