2014년 컴퓨터종합학술대회
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| 한글제목(Korean Title) |
HTCaaS를 활용한 대규모 신약재창출 시뮬레이션 |
| 영문제목(English Title) |
Large-Scale Drug Repositioning Simulation based on HTCaaS |
| 저자(Author) |
김직수
노승우
이민호
김서영
김상완
황순욱
Jik-Soo Kim
Seungwoo Rho
Minho Lee
Seoyoung Kim
Sangwan Kim
Soonwook Hwang
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| 원문수록처(Citation) |
VOL 41 NO. 01 PP. 0030 ~ 0032 (2014. 06) |
한글내용
(Korean Abstract) |
신약재창출(Drug Repositioning)이란 이미 시판 중이거나 임상 단계에서 안전성 이외의 이유로 산업화에 실패한 약물로부터 다른 질환에 대한 효과를 입증하는 것을 의미하며, 기존의 약(화합물)에 대해 다른 생리 활성이 있는지를 조사하기 위해 다른 단백질과의 상호작용을 탐색하는 과정으로 구성된다. 이러한 신약재 창출 과정은 대규모의 도킹(docking) 연산을 요구하며, 각각의 작업이 수십 초 정도 걸린다는 점에서 Many-Task Computing(MTC) 성격을 지니고 있다. 본 논문에서는 이러한 신약재창출 시뮬레이션의 효과적인 지원을 위해 KISTI 국가슈퍼컴퓨팅연구소에서 연구/개발한 HTCaaS(High-Throughput Computing as a Service) 시스템을 활용하여 PoC(Proof-of-Concept)를 수행한 결과를 제시하고자 한다. HTCaaS는 총 5개의 클러스터, 500 CPU Core를 활용하여 약 3만 6천개의 신약재창출 도킹 시뮬레이션을 약 40분 만에 성공적으로 수행함으로써 이러한 종류의 과학 응용 지원에 최적화되어있음을 실험적으로 보일 수 있었다.
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영문내용
(English Abstract) |
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