2012년 컴퓨터종합학술대회
Current Result Document :
| 한글제목(Korean Title) |
맵리듀스 기반의 암 특이적 유전자 단위 반복 변이 추출 |
| 영문제목(English Title) |
Highly accurate detection of cancer-specific copy number variations with MapReduce |
| 저자(Author) |
신재문
홍상균
이은주
윤지희
Jae-Moon Shin
Sang-Kyoon Hong
Un-Joo Lee
Jee-Hee Yoon
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| 원문수록처(Citation) |
VOL 39 NO. 1(C) PP. 0019 ~ 0021 (2012. 06) |
한글내용
(Korean Abstract) |
모든 암 세포는 체세포 변이를 동반한다. 따라서 암 유전체 변이 분석에 의하여 암을 발생시키는 유전자 및 진단/치료법을 찾아낼 수 있다. 본 연구에서는 차세대 시퀀싱 데이터를 이용하여 암 특이적 단어 반복 변이(copy number variation, CNFV) 유형을 밝히는 새로운 알고리즘을 제안한다. 제안하는 방식은 암 환자의 정상 세포와 암세포로부터 얻어진 정상 유전체와 암 유전체를 동시 분석하여 각각 CNV 후보 영역을 추출하며, 통계적 유의성 분석을 통하여 암 특이적 CNV 후보 영역을 선별하고, 다음 후처리 과정에서 참조 표준 서열(reference sequence)에 존재하는 오류 영역 보정 작업을 수행하여 정확한 암 특이적 CNV 영역을 추출해 낸다. 또한 다수의 대용량 유전체 데이터 동시 분석을 위하여 맵리듀스(MapReduce) 기법을 기반으로 하는 병렬 수행 알고리즘을 제안한다.
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영문내용
(English Abstract) |
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