정보처리학회 논문지 컴퓨터 및 통신시스템
Current Result Document :
| 한글제목(Korean Title) |
단백질 분자에서 변형된 채널 발견을 위한 유효 사이드 체인 배치 알고리즘 |
| 영문제목(English Title) |
An Algorithm for Computing Valid Side Chain Conformations for Finding Transformed Channels in a Protein Molecule |
| 저자(Author) |
최지훈
김병주
김구진
Jihoon Choi
Byungjoo Kim
Ku-Jin Kim
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| 원문수록처(Citation) |
VOL 04 NO. 01 PP. 0001 ~ 0004 (2015. 01) |
한글내용
(Korean Abstract) |
본 논문에서는 주어진 채널이 변형될 때, 아미노산들의 유효한 사이드 체인 배치(side chain conformation)를 찾는 알고리즘을 제시한다. 제안된 알고리즘은 아미노산의 유연성에 근거하여 사이드 체인 유연성을 가진 단백질 분자를 구현하고, 채널 변화에 영향을 주는 인접 아미노산(adjacent amino acid)을 추출한다. 인접 아미노산과 이웃(neighbor) 아미노산의 충돌 검사를 수행하여 유효하지 않은 사이드 체인 배치를 제거한 후, 회전각 조합 트리(rotation angle combination Tree)를 구성하여 사이드 체인 배치 중 유효한 것들만을 추출한다.
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영문내용
(English Abstract) |
This paper presents an algorithm for finding valid side chain conformations of amino acids, when given channel is transformed. Thesuggested algorithm implements a protein molecule with flexible side chains based on the flexibility of amino acids, and extracts adjacent amino acids that affect the formation of the channel. We detect the collision between adjacent amino acids and neighbors, in order to exclude invalid side chain conformations. Then, we construct the rotation angle combination tree to choose valid side chain conformations.
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| 키워드(Keyword) |
유연성을 가진 단백질 분자
사이드 체인 배치
Rotamer Angle
채널
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