2012년 추계 학술대회
Current Result Document :
| 한글제목(Korean Title) |
유사 전사체 모델 탐색을 위한 위치 기반 블록 간의 유사도 비교 기법 |
| 영문제목(English Title) |
A Position-Based Block Similarity Computing Method for Similar Transcript Model Search |
| 저자(Author) |
김소라
박태원
황혜련
조환규
Sora Kim
TaeWon Park
HyeRyeon Hwang
Hwan-Gue Cho
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| 원문수록처(Citation) |
VOL 19 NO. 02 PP. 1326 ~ 1329 (2012. 11) |
한글내용
(Korean Abstract) |
전사체(transcript)는 유전자로부터 전사된 DNA 시퀀스 코드를 말한다. 전사체(transcript)의 발현된 형태에 따라 생성되는 단백질의 형태 역시 달라지므로 전사체 모델의 형태는 중요한 의미를 가지며 특정 위치의 전사체가 정상과 다르게 모델이 변할 경우 심각한 경우에는 유전자 질병에 노출될 수 있다. 현재 실험체에 대한 전사체 모형은 SpliceGrapher, Cufflinks와 같은 상용화된 도구들을 사용하여 얻을 수 있다. 하지만 이런 도구 간의 결과 값 및 어노테이션 정보와 결과 값 간의 유사도 비교를 위한 방법론은 현재 알려진 바 없다. 대신 전사체 비교를 위해 모형 간의 차이를 눈으로 하나씩 비교하거나 전사체 위치를 이용한 산수 값을 이용한다. 본 논문에서는 전사체 모형 간의 유사도를 비교하기 위한 방법론을 제시하고 Homo sapiens grch37 어노테이션 파일과 SRR387514 실험 데이터 간의 유사도를 제시한 방법론을 이용하여 측정한 결과 값을 분석하였다.
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영문내용
(English Abstract) |
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